In 1840 kocht Minne Haikes van der Werf een bestaande werf aan de zuidelijke oever van het vroegere tracé van het Kolonelsdiep ten oosten van het centrum van Kootstertille. In 1888 werd Joon Molles van der Werf eigenaar. De technische ontwikkelingen volgens, werd geleidelijk overgeschakeld van de bouw van houten schepen, naar die van staal-ijzeren schepen. Na 1900 werden er alleen nog maar ijzeren en stalen schepen gebouwd. In 1911 vertrok Joon naar Harlingen om daar de werf "Welgelegen" nieuw leven in te blazen. Zoon Molle zette de werf in Kootstertille voort tot 1921, waarna hij zijn bezittingen verkocht aan zijn zoon Harm van der Werff. Vanaf 1964 tot 1975 werden de opstallen gebruikt door Jacht- en Scheepswerf M. Miedema, die op die plaats later ook een paar schokkers heeft gebouwd.
Het Skûtsje 'Twee Gezusters' is in 1908 gebouwd voor Jan van der Schaaf. Die had toen twee dochters, vandaar de naam. In 1926 trouwt Tiemen Jaspers met dochter Trijntje en neemt het schip over. Hij verkoopt het skûtsje in 1971.
De werf van de familie van der Werf in Kootstertille